diff --git a/drivers/pci/host/pci-msm.c b/drivers/pci/host/pci-msm.c
index 05b56f17646a..14af8ca66d1c 100644
--- a/drivers/pci/host/pci-msm.c
+++ b/drivers/pci/host/pci-msm.c
@@ -1760,7 +1760,8 @@ static inline int msm_pcie_check_align(struct msm_pcie_dev_t *dev,
 
 static bool msm_pcie_confirm_linkup(struct msm_pcie_dev_t *dev,
 						bool check_sw_stts,
-						bool check_ep)
+						bool check_ep,
+						void __iomem *ep_conf)
 {
 	u32 val;
 
@@ -1787,7 +1788,7 @@ static bool msm_pcie_confirm_linkup(struct msm_pcie_dev_t *dev,
 	}
 
 	if (check_ep) {
-		val = readl_relaxed(dev->conf);
+		val = readl_relaxed(ep_conf);
 		PCIE_DBG(dev,
 			"PCIe: device ID and vender ID of EP of RC %d are 0x%x.\n",
 			dev->rc_idx, val);
@@ -1816,6 +1817,10 @@ static void msm_pcie_cfg_recover(struct msm_pcie_dev_t *dev, bool rc)
 			cfg = dev->dm_core;
 			shadow = dev->rc_shadow;
 		} else {
+			if (!msm_pcie_confirm_linkup(dev, false, true,
+				dev->pcidev_table[i].conf_base))
+				continue;
+
 			shadow = dev->ep_shadow[i];
 			PCIE_DBG(dev,
 				"PCIe Device: %02x:%02x.%01x\n",
@@ -4566,11 +4571,11 @@ int msm_pcie_enable(struct msm_pcie_dev_t *dev, u32 options)
 		usleep_range(LINK_UP_TIMEOUT_US_MIN, LINK_UP_TIMEOUT_US_MAX);
 		val =  readl_relaxed(dev->elbi + PCIE20_ELBI_SYS_STTS);
 	} while ((!(val & XMLH_LINK_UP) ||
-		!msm_pcie_confirm_linkup(dev, false, false))
+		!msm_pcie_confirm_linkup(dev, false, false, NULL))
 		&& (link_check_count++ < LINK_UP_CHECK_MAX_COUNT));
 
 	if ((val & XMLH_LINK_UP) &&
-		msm_pcie_confirm_linkup(dev, false, false)) {
+		msm_pcie_confirm_linkup(dev, false, false, NULL)) {
 		PCIE_DBG(dev, "Link is up after %d checkings\n",
 			link_check_count);
 		PCIE_INFO(dev, "PCIe RC%d link initialized\n", dev->rc_idx);
@@ -6484,7 +6489,8 @@ static int msm_pcie_pm_suspend(struct pci_dev *dev,
 	}
 
 	if (dev && !(options & MSM_PCIE_CONFIG_NO_CFG_RESTORE)
-		&& msm_pcie_confirm_linkup(pcie_dev, true, true)) {
+		&& msm_pcie_confirm_linkup(pcie_dev, true, true,
+			pcie_dev->conf)) {
 		ret = pci_save_state(dev);
 		pcie_dev->saved_state =	pci_store_saved_state(dev);
 	}
@@ -6993,7 +6999,7 @@ int msm_pcie_recover_config(struct pci_dev *dev)
 		return -ENODEV;
 	}
 
-	if (msm_pcie_confirm_linkup(pcie_dev, true, true)) {
+	if (msm_pcie_confirm_linkup(pcie_dev, true, true, pcie_dev->conf)) {
 		PCIE_DBG(pcie_dev,
 			"Recover config space of RC%d and its EP\n",
 			pcie_dev->rc_idx);